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| Registros recuperados : 52 | |
| 7. |  | GRYNBERG, P.; GUIMARÃES, L. A.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; BRASILEIRO, A. C. M.; GUIMARAES, P. M. Comprehensive profiling and characterization of Arachis stenosperma (peanut) and Meloidogyne arenaria (plant-root nematode) small-RNAs identified during the course of the infection. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 13., 2017, São Pedro. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2017. p. 170| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 10. | | SALGADO, F. F.; LEAO, A. P.; GRYNBERG, P.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T. Prediction and annotation of miRNAs and the preponderant role of transcription factors in the response of Elaeis guineensis Jacq to abiotic stresses of drought and salinity. In: BRAZILIAN SYMPOSIUM ON BIOINFOMATICS (BSB 2023), 16., 2023, Curitiba, PR. [Proceedings...]. Porto Alegre, RS: Sociedade Brasileira de Computação, 2023.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 11. | | GOMES, T. G.; ALVES, G. S. C.; HADI, S. I. I. A.; COSTA, M. M. do C.; MENDONCA, S.; MILLER, R. N. G.; SIQUEIRA, F. G. de. Expressão diferencial de genes em Pleurotus pulmonarius associados a degradação enzimática e destoxificação da torta de pinhão-manso. In: ENCONTRO DE PESQUISA E INOVAÇÃO DA EMBRAPA AGROENERGIA, 5., 2018, Brasília, DF. Anais ... Brasília, DF: Embrapa Agroenergia, 2018. p. 18.| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 12. | | BERGMANN, J. C.; COSTA, M. M. do C.; JUNIOR, P. G. J.; BARRETO, C. C.; KRUGER, R. H.; QUIRINO, B. F. Soil bacterial community structure associated with oil palm (Elaeis guineensis) fatal yellowing disease. In: SYMPOSIUM ON BIOTECHNOLOGY FOR FUELS AND CHEMICALS, 36., 2014, Flórida. Abstracts... Fairfax: Society for Industrial Microbiology and Biotechnology, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia. |
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| 13. | | ANDRADE, E. L. P. de; LOPES JUNIOR, S.; COSTA, M. M. do C.; RAMOS, R. G. C.; FARIAS, J. L. S.; SILVA, A. M. D.; PROCOPIO, C. D. Utilização de tecnologia orientada a objetos no desenvolvimento de sistemas de informação corporativos na Embrapa. In: TURAZI, A. (Ed.). O recurso tecnologia da informação em uma instituição de pesquisa agropecuária: de 1974 a 2000. Brasília, DF: Embrapa Comunicação para Transferência de Tecnologia, 2001. p. 195-224.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 14. | | FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; ALVES, R. M.; ALBUQUERQUE, P. S. B.; MARCELLINO, L. H. Analyses of cupuassu (Theobroma grandiflorum) transcriptome during interaction with Moniliophthora perniciosa, the causal agent of Witches' Broom disease. In: BRAZILIAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 7.; BIOTECHNOLOGY IBERO-AMERICAN CONGRESS, 2., 2018, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: SBBiotec, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 15. | | FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; ALVES, R. M.; ALBUQUERQUE, P. S. B.; MARCELLINO, L. H. Analyses of cupuassu (Theobroma grandiflorum) transcriptome during interaction with Moniliophthora perniciosa, the causal agent of Witches' Broom disease. In: BRAZILIAN BIOTECHNOLOGY CONGRESS, 7.; BIOTECHNOLOGY IBERO-AMERICAN CONGRESS, 2., 2018, Brasília, DF. Proceedings... Brasília, DF: SBBiotec, 2018.| Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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| 16. | | MÜLLER, B. S. de F.; SAKAMOTO, T.; SILVEIRA, R. D. D.; ZAMBUSSI-CARVALHO, P. F.; PEREIRA, M.; PAPPAS JUNIOR, G. J.; COSTA, M. M. do C.; GUIMARÃES, C. M.; PEREIRA, W. J.; BRONDANI, C.; VIANELLO-BRONDANI, R. P. Differentially expressed genes during flowering and grain filling in common bean (Phaseolus vulgaris) grown under drought stress conditions. Plant Molecular Biology Reporter, Athens, v. 32, p. 438-451, 2014.| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 17. | | SALGADO, F. F.; SILVA, T. L. C. da; VIEIRA, L. R.; SILVA, V. N. B.; LEAO, A. P.; COSTA, M. M. do C.; TOGAWA, R. C.; SOUSA, C. A. F. de; GRYNBERG, P.; SOUZA JUNIOR, M. T. The early response of oil palm (Elaeis guineensis Jacq.) plants to water deprivation: Expression analysis of miRNAs and their putative target genes, and similarities with the response to salinity stress. Frontiers in Plant Science, n. 13, 970113, 2022.| Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Meio-Norte; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 18. | | CASTAÑEDA, N. E. N.; ALVES, G. S. C.; ALMEIDA, R. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SANTOS, J. R. P.; CARES, J. E.; MILLER, R. N. G. Gene expression analysis in Musa acuminata during compatible interactions with Meloidogyne incognita. Annals of Botany, v. 119, p. 915-930, 2017.| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura; Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 19. | | GARIGHAN, J.; DVORAK, E.; ESTEVAN, J.; LORIDON, K.; HUETTEL, B.; SARAH, G.; FARRERA, I.; LECLERCQ, J.; GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; COSTES, E.; ANDRÉS, F. The identification of small RNAs differentially expressed in apple buds reveals a ootential role of the Mir159-MYB regulatory module during dormancy. Plants, v. 10, 2665, 2021.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| 20. | | MICHEREFF, M. F. F.; GRYNBERG, P.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; LAUMANN, R. A.; ZHOU, J.-J.; SCHIMMELPFENG, P. H. C.; BORGES, M.; PICKETT, J. A.; BIRKETT, M. A.; MORAES, M. C. B. Priming of indirect defence responses in maize is shown to be genotype-specific. Arthropod-Plant Interactions, v. 15, p. 313-328, 2021. Na publicação: Marcos M. C. Costa; Maria Carolina Blassioli-Moraes.| Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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| Registros recuperados : 52 | |
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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Data corrente: |
04/05/2021 |
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Data da última atualização: |
25/04/2024 |
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Tipo da produção científica: |
Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento |
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Autoria: |
LEMOS, V. N. S.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; RECH FILHO, E. L.; GRYNBERG, P. |
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Afiliação: |
VINÍCIUS NATTAN SILVA LEMOS; ROBERTO COITI TOGAWA, CENARGEN; MARCOS MOTA DO CARMO COSTA, CENARGEN; ELIBIO LEOPOLDO RECH FILHO, CENARGEN; PRISCILA GRYNBERG, CENARGEN. |
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Título: |
Combinação de abordagens de análises de novo e guiadas pelo genoma para explorar dados de RNA-Seq de sementes oleaginosas para anotação de vias de ácidos graxos. |
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Título original: |
Analysis of the de novo and genome-guided approaches in combination to explore RNA-Seq data from oilseeds for fatty acid pathways annotation. |
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Ano de publicação: |
2021 |
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Fonte/Imprenta: |
Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2021. |
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Páginas: |
33 p. |
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Série: |
(Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Boletem de Pesquisa e Desenvolvimento, 369.) |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Elaeis guineensis (dendê), Jatropha curcas (pinhão-manso) e Ricinus communis (mamona) produzem ácidos graxos que podem ser utilizados como fonte renovável na matriz energética, apresentando um grande potencial biotecnológico para as indústrias da área. O objetivo deste trabalho foi identificar transcritos relacionados com a síntese de ácidos graxos e inferir a sua presença em vias metabólicas. Para isso, o RNA total de sementes destas três espécies foi extraído e sequenciado. Os transcritomas foram montados utilizando abordagens de novo e guiados pelo genoma e filtrados com o programa Evidential Gene para a obtenção de resultados robustos. Uma base de dados contendo 527 sequências de 170 códigos de enzimas únicos de 12 vias de metabolismo de ácidos graxos foi gerada. Um total de 152, 156 e 150 transcritos de E. guineensis, J. curcas e R. communis referentes às proteínas pertencentes à 12 vias de metabolismo de ácidos graxos foram encontradas respectivamente, sendo 135 em comum. Os resultados ainda sugerem que há proteínas com expressão tecido-específicos pois 23, 6 e 11 proteínas de interesse de E. guineensis, J. curcas e R. communis não foram encontradas nos transcritomas, respectivamente. A estratégia desenvolvida neste trabalho mostrou ser eficiente para a mineração de dados de interesse em dados de RNA-Seq com baixa cobertura pois o uso de diferentes programas de montagem potencializou a identificação das proteínas. |
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Palavras-Chave: |
Pinhão-manso; RNA-Seq; Vias metabólicas. |
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Thesagro: |
Dendê; Elaeis Guineensis; Jatropha Curcas; Mamona; Ricinus Communis. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/223039/1/Boletim-rnaseq-369-finalabril1.pdf
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Marc: |
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700 1 $aRECH FILHO, E. L.
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Registro original: |
Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (CENARGEN) |
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